Несмотря на то, что я уже давно являюсь завзятым поклонником KeePass и категорически не приемлю другие решения, оказывается, существует интересный проект, позволяющий хранить свои пароли в git.
К сожалению, на данный момент, в репозиториях wheezy этой утилиты пока нет, поэтому в Debian устанавливать придется из бекпортов.